En 2019, Édgar Villegas presentó un informe detallado, elaborado con la colaboración de un equipo de profesionales, que revelaba irregularidades identificadas a raíz de una comparación entre los registros del sistema Transmisión de Resultados Electorales Preliminares (TREP) y el conteo oficial de votos.

Este ingeniero informático se encuentra ahora bajo imputación formal por supuestamente incitar a la comisión de actos delictivos de manera pública. El proceso legal en su contra fue iniciado tras una denuncia presentada por el diputado del Movimiento Al Socialismo (MAS), perteneciente al ala evista, Renán Cabezas. Cabezas acusó a Villegas de ser uno de los responsables de agitar la situación social en el país, así como de contribuir a la destrucción de bienes y la persecución de ciertos actores políticos a raíz de sus declaraciones sobre un presunto fraude electoral.

En el contexto de las elecciones de 2019, Villegas elaboró un informe que señalaba discrepancias entre los datos del sistema TREP, utilizado por el Tribunal Supremo Electoral (TSE) para difundir resultados preliminares no oficiales el día de la votación, y el cómputo oficial de votos, obtenido a través de la verificación de actas físicas por parte de los Tribunales Electorales Departamentales (TED) en los nueve departamentos del país.

Estas elecciones, celebradas en octubre de 2019, desencadenaron una crisis nacional que duró 21 días, provocada por denuncias de un posible fraude electoral. La situación culminó con la anulación de los comicios y la renuncia del entonces presidente Evo Morales, tras la divulgación de una auditoría realizada por la Organización de Estados Americanos (OEA) que reveló irregularidades graves e una manipulación dolosa en el proceso electoral.